地球遭到不明生物攻击，经调查是一种外来生物，是外星人利用恐龙基因重组新创的一种残暴复合恐龙，外星人想占领地球，为保卫地球，蓝猫等人奉命前往恐龙时代寻找恐龙基因。来到恐龙时代后，被救助的鸭嘴龙带蓝猫、淘气来到恐龙家族，恐龙家族把他们看作英雄，结下深厚友谊。在鸭嘴龙的帮助之下，暴风雨夜，蓝猫和伙伴们找到了的植食恐龙——副栉龙的家族。霸王龙，在恐龙家族中非常孤单，

《蓝猫淘气3000问》，是中国第一部大型科普动画系列故动画片。它以“知识卡通”的艺术创意走出了自己的道路。它透过主角“蓝猫”和伙伴们的历险过程，利用其遇到的问题，向小朋友提供宇宙星空、生态环境、人文历史、生物百观等方面的知识，既有人类几千年灿烂文化的结晶，又有当代高新科技知识的概览，是知识经济时代电子版的青少年百科全书。